Kitaro est un jeune garçon de la race des Yokai. Les Yokai sont des sortes de monstres éteints depuis des années. Le jeune Kitaro aime ce réfugier au cimetière pour se relaxer. Son beau-père, s'étant remarié avec sa mère après la mort de son véritable père, détestait le jeune Yokai. Il lui à même enlevé son oeil gauche... Medama-Oyaji, son véritable père, ce réincarna en oeil. Il peut maintenant veiller sur Kitaro en le suivant partout où il va. Ces deux personnages s'aperçurent que, finalement, ils n'étaient pas les derniers Yokai encore existant ! Ils doivent maintenant accepter cette réalité, qu'elle soient bonne ou mauvaise...